ABSTRACT
Trypanosoma vivax foi descrito por Zieman, (1905) do sub-gênero Dutonella, família Trypanosomatidae, é um protozoário patogênico causador de tripanossomose na África e na América Latina. Infecta bovinos, ovinos e outros mamíferos silvestres, não infecta o homem e equinos. Os principais sinais clínicos são: anemia, perda de apetite, efeitos na fertilidade, no sistema nervoso central, aborto e até á morte. Transmitido pela mosca tsétsé e tabanídeos, causa grandes perdas econômicas na pecuária. No Brasil, surtos tem sido relatados em Belém- PA, Calçoene-AP, no Pantanal (MS e MT) e Catolé da Rocha-PB. Apesar do impacto econômico relevante e importância médico-veterinária, há pouco conhecimento sobre sua biologia e genoma. Um fator limitante é a dificuldade de cultivo in vivo e in vitro. Com o intuito de obter informações sobre quais genes estão sendo transcritos e realizar uma análise comparativa com a cepa africana Y486, foram sequenciados mais de 4208 clones de cDNAs de um isolado do Pantanal-Brasil VTA-01 de T. vivax e 768 clones genômicos da cepa africana Y486. As sequências foram armazenadas e analisadas no sistema STINGRAY (http://stingray.biowebdb.org/). Após remoção das sequências de baixa qualidade e agrupamento foram analisadas 2557 ESTs e 81 GSSs, com tamanho médio de 497 pb e 500 pb e conteúdo G+C de 43% e 55%, respectivamente. Após pesquisa de similaridade usando diferentes programas como BLAST, RPS-Blast, InterProScan e HMMER, 77% (1746/2638) apresentaram hit. Os principais domínios encontrados foram NADH, RhoA, Rac1 GTPases e Drf_FH1. Usando o programa RepeatMasker foram encontrados as repetições (CA)n, (GA)n e (TA)n e os retrotransposons SINE e LINE. Um total de 217 ESTs espécie-específicas para T. vivax foram identificadas e apresentaram preferencialmente A ou T na terceira posição do codon nas regiões codificantes (CDSs). Destas 88% (191/217) possuem índice RCBS 0,5, com alto nível de expressão e 12% (26/217) RCBS menor 0,5 com baixo nível de expressão. Os genes altamente expressos foram associados com vias de duplicação do DNA, transcrição, tradução, organização celular e formação de actina no citoesqueleto. A localização de domínios G-quadruplex foram encontrados tanto dentro quanto fora da CDS e próximas as extremidades 5 e 3 das CDSs e dos ESTs. Nas análises comparativas, a proteína extensina está presente no isolado VTA-01 e cepa Y486 de T. vivax. Aproximadamente 83% das ESTs validaram sequências do projeto genoma de T. vivax. As informações geradas neste projeto irão contribuir para um melhor conhecimento sobre a biologia deste parasita.